Glavna odlika prirodnih vrednosti Obedske bare je integralnost ekosistema bara, močvara, okana, livada i šuma, uslovljena sezonskim plavljenjem i spletom greda, dolja i lesnih terasa, od čega zavisi opstanak živog sveta. Obedska bara se sastoji od nekoliko većih očuvanih prostornih celina: Kupinske grede, Potkovica, Čenjin, Širine, Vitojevačko-grabovačko ostrvo,  Kupinski kut, Jasenska, Matijevica, Kadionica, Bena, Visoka šuma i Lošinci. Unutar prirodnog dobra nalaze se dva područja sa temeljnim prirodnim vrednostima: Kupinske grede-Potkovica (istočni deo rezervata) i Širine-Revenica (zapadni deo). Dok je u 19. veku na ovom prostoru postojala ravnoteža površina i prostornog rasporeda šuma-bara-livada, nakon 100 godina prirodnim procesima i ljudskim uticajem došlo je do značajnog narušavanja tog odnosa. U savremeno doba u SRP “Obedska bara” šume zauzimaju 65% površine, plantaže topola 17%, bare 15%,  a vlažne livade i pašnjaci svega 3%. Imajući u vidu značaj otvorenih prirodnih staništa za biološku i predeonu raznolikost, pokrenut je dugoročni projekat revitalizacije vlažnih livada i pašnjaka, kao i plitkih bara.